Viele CEC-Bahnhöfe liegen 100 und mehr Kilometer voneinander entfernt. Daher ist der CEC (wie seine Vorbilder TGV und ICE im Personenverkehr) nicht in der Lage, allein allen Kundenwünschen gerecht zu werden. Als Ergänzung schlägt Jörg Schäfer daher Container-Interregios (CIR) vor, die einerseits Frachten von CEC-Bahnhöfen aus näher zum Kunden bringen, andererseits aber auch dem Binnenverkehr abseits der Hauptachsen dienen. Gerade letzteres könnte viele Transporte auf die Schiene zurück bringen, die dank der fragwürdigen Geschäftspolitik der Deutschen Bahn AG in den letzten Jahren an die Straße verloren wurden.

Leitgedanke bei der Netzgestaltung ist, dass auf jeder Linie alle 2 Stunden ein Triebwagen fährt. Auf allen Hauptrouten soll es mindestens zwei Linien geben, deren Triebwagen zusammen gekuppelt werden und dadurch die Netzkapazität gut ausschöpfen. (Z.B. Linien 40 und 42 zwischen Mannheim und Offenburg und die Linien 40 und 41 zwischen Offenburg und Basel.)

Die meisten Linien, die in Deutschland fahren, werden keine Grenze zu einem Nachbarstaat überfahren. Insgesamt sieht der Autor 52 CIR-Linien für Bayern und Baden-Württemberg mit einer Länge von 8.357 km vor. Da die Fläche und die prognostizierte Verkehrsleistung für 2015 rund 30% Deutschlands entsprechen, können bundesweit 170 CIR-Linien mit einer Länge von rund 28.000 km hochgerechnet werden.